我院刘雪明教授指导本科生在生物信息学权威期刊BIB发表研究成果

近日，由我院刘雪明教授带领的本科生研究团队，在生物信息学领域权威期刊 Briefings in Bioinformatics（BIB） 上发表了题为《BioMNEDR: Mechanism-Guided Network Embedding for Drug Repurposing》的药物重定位相关研究论文。该论文的第一作者为团队中的本科生曾逸舟同学，刘雪明教授为通讯作者。

Briefings in Bioinformatics（BIB） 是生物信息学与计算生物学领域的权威国际期刊，聚焦该方向的最前沿研究与技术应用，影响因子为7.7。

药物重定位（Drug Repurposing）是创新药物研发的重要途径之一，通过发现已上市药物在新疾病中的潜在疗效，可以显著降低研发成本并缩短研发周期。然而，由于药物—疾病关系往往涉及复杂的多层次生物医学机制，如何从海量生物医学数据中有效挖掘具有生物学意义的关联关系，仍然是该领域的重要研究挑战。

针对这一难题，在刘雪明教授的悉心指导下，本科生曾逸舟同学开展了深入研究，并提出了一种生物医学机制引导的网络嵌入方法 BioMNEDR。该方法通过基于生物学知识验证的元路径整合异质生物医学网络，构建能够保留蛋白质—蛋白质相互作用及功能层级信息的低维嵌入表示，并实现多机制信息的融合建模，从而有效提升了药物—疾病关联预测的准确性与可解释性。

实验结果表明，该方法在AUROC、AUPR等评价指标上均优于现有主流方法，并成功为阿尔茨海默病、帕金森病和乳腺癌等疾病识别出多个潜在候选药物，为系统性药物重定位研究提供了一种兼具预测性能与生物可解释性的计算框架。

该研究成果是刘雪明教授团队在生物医学大数据挖掘与人工智能交叉领域取得的又一重要进展。在研究过程中，曾逸舟同学从问题调研、方法设计、实验分析到论文撰写与投稿修改，完整参与了科研全过程，得到了全面的科研实践训练。这充分体现了刘雪明教授在人才培养中坚持的“以高水平科研支撑高质量育人”的理念，展现了我院教师在本科生科研能力培养方面的显著成效。

刘雪明教授是国家自然科学基金委优秀青年科学基金项目获得者，人工智能与自动化学院、医疗装备科学与工程研究院双聘教授，博士生导师。她长期致力于复杂网络韧性分析与调控、基于AI的复杂系统临界点预测及其在生物分子网络等系统上的应用等研究。相关研究成果以第一或通讯作者发表在 Nature Communications、PNAS、Physics Reports、Engineering、Briefings in Bioinformatics 等国际权威期刊上。曾获2022年湖北省自然科学一等奖，2020年湖北省优秀学士学位论文指导教师等奖励。

该研究以华中科技大学为第一完成单位，并得到了国家自然青年科学基金项目（B类）（T2422010）的资助。